但是性病如果感染的时间很长，不但有阴道、不孕宫颈的女性感染，同时上行导致盆腔感染，感染一直未经治疗或断断续续治疗，性病长期不愈，这种情况会导致女性输卵管粘连变形，以致输卵管闭锁，从而导致不孕不育。如果输卵管的病变使其变得狭窄、不完全粘连，又未避孕，那么精子与卵子在输卵管部位受精后，分裂的桑葚胚不能被顺利地送到子宫腔内，而被阻在变形狭窄的输卵管内，胚胎就会在那里不断发育，造成宫外孕。
20世纪80年代以后被称为第二代性传播疾病的生殖道支原体、衣原体感染，如果感染时间长，已经导致输卵管变形，即便已经治愈了（检测呈阴性），已变形的输卵管也很难自行转变成正常的输卵管，还是可能出现宫外孕、不孕。对这样的病人，最好在孕前做输卵管检查。
生殖道支原体、衣原体感染造成的输卵管病变可以称之为性病的后遗症，它只是性病后遗症中的一种。其他的性病如淋病、梅毒、性病性淋巴肉芽肿等均会不同程度遗留下后遗症或出现并发症。所以患了性病应及时到正规医院进行正规治疗，并与性伴同时治疗，尽量避免后遗症和并发症的发生。
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